Όταν το ισχυρό εξωγήινο συμβιωτικό που μετατρέπει τον Spider-Man στον Black-Suited Spider-Man καταστρέφει τα πάντα στο πέρασμά του, μόνο ο Spider-Man μπορεί να πάρει την κατάσταση στα χέρια του και να σώσει τη Νέα Υόρκη απο τον όλεθρο! Στo Web of Shadows παίρνετε τη θέση του αγαπημένου σας ήρωα επηρεάζοντας την κατεύθυνση και την κατάληξη του παιχνιδιού με τις αποφάσεις που παίρνετε κατα τη διάρκειά του.