Στο Pokemon Conquest, οι παίκτες αναλαμβάνουν τον ρόλο ενός νεαρού Πολέμαρχου, ο οποίος έχει έναν μοναδικό σύνδεσμο με ένα Pokemon. Μαζί θα πρέπει να στρατολογήσουν άλλους Πολεμιστές ως συμμάχους και να ενισχύσουν το αναπτυσσόμενο βασίλειό τους. Το παιχνίδι περιλαμβάνει σχεδόν 200 Pokemon, μεταξύ των οποίων και αρκετά από τα πρόσφατα παιχνίδια Pokemon Black και Pokemon White.