21 Ιανουαρίου 1968, ένα B-52G που μεταφέρει τέσσερεις θερμοπυρηνικές βόμβες προσκρούει στην Αρκτική Θάλασσα δίπλα στην αεροπορική βάση Thule. Μία ομάδα αναζήτησης βρίσκει τα ερίπεια και τρείς βόμβες. Η τέταρτη βόμβα λείπει.

Ο αρχηγός της Ρώσικης Μαφίας Yebievdenkο, έχει ένα νέο παιχνίδι προς πώληση, μία ατομική βόμβα. Η CIA μαθαίνει τα σχέδια του, που είναι να πουλήσει την βόμβα στον δικτάτορα της Λυβίης. O φόβος είναι ότι θα χρησιμοποιηθεί σε τρομοκρατικές επιθέσεις ενάντια στην Αμερική.

Το Global Ops: Commando Libya είναι ένα παιχνίδι τρίτου προσώπου που βάζει τον παίχτη στην καρδιά ενος αγώνα για να πάρετε την πυρηνική κεφαλή που εκλάπει από την Ρώσικη Μαφία. Θα πάρετε μέρος σε μάχες μέσα στην Βόρεια Αφρική και θα αντιμετωπίσετε τρομοκράτες.