Καθώς ο αγώνας για έλεγχο αυξανόταν μεταξύ των Daimyos των εθνών, αυξήθηκαν οι εντάσεις μεταξύ των δύο μεγάλων εθνών, καθένα από τα οποία φιλοξενούσε μία από τις μεγαλύτερες σχολές πολεμικών τεχνών. Το Compa Style που έχει κατακτήσει τις τέχνες Ninja βασισμένες στην Τεχνική Διοίκησης . Το στυλ Honeypa που έχει κατακτήσει τις τέχνες Ninja με τις ρίζες του στην Τεχνική Δράσης . Τα δύο στρατόπεδα είχαν κολλήσει σε έναν αδίστακτο ανταγωνισμό δεξιοτήτων προκειμένου να επιτύχουν ηγεμονία, αλλά καθώς αγωνίζονταν, ένας μυστηριώδης στρατός μηχανικών νίντζα ??επιτέθηκε. Ο μηχανικός στρατός των νίντζα ??κατέκτησε τα μικρότερα έθνη σε μια στιγμή και ο αρχηγός του, Yoh Gamer , έκανε μια ανακοίνωση στον κόσμο.