Σε ένα μακρινό μέλλον, ανακαλύφθηκε μια ψιονική ορμόνη στον ανθρώπινο εγκέφαλο, η οποία παρέχει στους ανθρώπους εξωαισθητηριακές δυνάμεις και αλλάζοντας τον κόσμο όπως τον ξέρουμε. Την ώρα που η ανθρωπότητα έμπαινε σε αυτή τη νέα εποχή, διαταραγμένοι μεταλλαγμένοι γνωστοί ως ’λλοι άρχισαν να κατεβαίνουν από τον ουρανό με δίψα για ανθρώπινους εγκεφάλους. Ιδιαίτερα ανθεκτικό στις συμβατικές μεθόδους επίθεσης, έπρεπε να ληφθούν ακραία μέτρα για την καταπολέμηση της συντριπτικής απειλής και τη διατήρηση της ανθρωπότητας. Εκείνοι με οξείες εξωαισθητηριακές ικανότητες, γνωστοί ως psionics, ήταν η ευκαιρία μας να πολεμήσουμε την επίθεση από ψηλά. Μέχρι σήμερα, οι ψιονικοί έχουν αναζητηθεί για τα ταλέντα τους και έχουν στρατολογηθεί στην ’λλη Δύναμη Καταστολής (OSF), την τελευταία γραμμή άμυνας της ανθρωπότητας. Αναλάβετε τον ρόλο του Yuito Sumeragi, ενός νεοσύλλεκτου στο OSF που στοχεύει να γίνει ένας ελίτ ψωνολόγος σαν αυτόν που τον έσωσε ως παιδί. Οπλισμένοι με ταλέντο στην ψυχοκίνηση, εξερευνήστε τη φουτουριστική πόλη του New Himuka και αποκαλύψτε τα μυστήρια ενός μέλλοντος Brain Punk που παγιδεύεται ανάμεσα στην τεχνολογία και τις ψυχικές ικανότητες στο SCARLET NEXUS.