Η φυσικότητα του σύγχρονου παιχνιδιού έχει βελτιωθεί στο PES 2016 με σημαντικά ανανεωμένο το σύστημα σύγκρουσης, υπολογίζοντας πώς αλληλοεπιδρούν οι παίκτες και δημιουργώντας ένα μοναδικό αποτέλεσμα, ανάλογα με το είδος της πρόσκρουσης.

Με το νέο σύστημα που δίνει βάση στον σωματότυπο του παίχτη οι μονομαχίες στον αέρα είναι μια εντελώς μοναδική εμπειρία στο PES 2016.

Κάνοντας προβολή στον κατάλληλο χρόνο αυτό θα κάνει τον επιτιθέμενο παίχτη να χάσει την μπάλα και να κερδίσετε εσείς την κατοχή.

Σε μια προσπάθεια να βελτιωθεί η ποιότητα και να προστεθεί μοναδικότητα στην απόδοση, νέες παράμετροι τερματοφύλακα έχουν προστεθεί.

Οι παίκτες θα έχουν τον πλήρη έλεγχο των πανηγυρισμών μετά από κάποιο goal ώστε να μεγιστοποιήσουν τον ενθουσιασμό τους όταν σκοράρουν.

Το διάσημο και εξαιρετικά δημοφιλές Master League έχει αλλάξει με νέα στοιχεία, επιτρέποντας στους χρήστες να βυθιστούν στον διοικητικό κόσμο του ποδοσφαίρου.

Εκμετάλλευση των πολλών εξελίξεων της Fox Engine. Οι εικόνες έχουν δεχθεί τεράστια αναβάθμιση. Για παράδειγμα οι παίκτες θα βουτάνε στην βροχή για να κερδίσουν την κατοχή. Νέος νυχτερινός φωτισμός και πραγματική υφή χλοοτάπητα είναι μερικές από τις βελτιώσεις.

Για πρώτη φορά στη σειρά PES, έχει εισαχθεί η δυναμική καιρού, με την έναρξη της βροχής κατά τη διάρκεια του παιχνιδιού και όχι από την αρχή. Σε συνδυασμό με την ολοένα και πιο ρεαλιστική φυσική της μπάλας, η βροχή παίζει σημαντικό ρόλο στην ροή του παιχνιδιού. Ο αμυντικός είναι πιο πιθανό να γλιστρήσει και να πέσει λόγω του βρεγμένου γηπέδου.

Προσπαθώντας να γίνει πιο ρεαλιστική η κίνηση του παίκτη, 3 νέα animation έχουν προστεθεί. Οι τερματοφύλακες έχουν τώρα μια πληθώρα από κινήσεις ενώ τα σουτ, οι πάσες, οι ντρίπλες και τα τάκλιν θα αλλάζουν animation ανάλογα με την περίσταση.