Βασισμένο στην δεύτερη season κινουμένων σχεδίων του Bakugan (New Vestria) στο Bakugan Battle Brawlers : Defender of the Core, οι παίχτες θα δημιουργήσουν έναν νέο ήρωα και θα τον οδηγήσουν σε μια επική περιπέτεια για να σώσουν τις γήινες πόλεις από τον Spectra και τoυς Vexos στρατιώτες του. Οι παίχτες θα ανακαλύψουν μια νέα πτυχή του Bakugan που δημιούργησαν αποκτώντας τον πλήρη έλεγχο τους είτε ως μικρές μπάλες είτε ως γιγάντια πλάσματα. Κάθε Bakugan που δημιουργεί ο παίχτης έχει τις δικές του ιδιότητες και κινήσεις τις οποίες θα πρέπει να ανακαλύψει και να προσαρμόσει στο παιχνίδι. Κατά την διάρκεια του παιχνιδιού οι παίχτες θα ανακαλύψουν και θα ξεκλειδώσουν νέα levels και χαρακτήρες που θα τους βοηθήσουν να νικήσουν τους εχθρούς τους και να σώσουν την γη από την πλήρη καταστροφή.