Στο έτος 2062 η ανθρωπότητα είναι στο χείλος της καταστροφής. Η εξωγήινη κρυσταλική μορφή που αποτέλεσε την αιτία για το πολύχρονο πόλεμο μεταξύ GDI και NOD έχει κατακλίσει τον πλανήτη και απειλεί με την εξαφάνιση του ανθρωπίνου γένους. Μπροστά σε αυτό τον κίνδυνο, οι δύο δυνάμεις ναγκάζονται να συνεργαστούν. Μετά από 15 χρόνια, έχει δημιουργηθεί ένα δίκτυο προστασίας και το Tiberium βρίσκεται υπο έλεγχο. Τότε είναι που οι πολίτες έχουν αρχίσει και αναρωτιούνται γιατί ο Kane προσφέρθηκε να βοηθήσει και τι ζητά σαν αντάλλαγμα. Με νέα χαρακτηριστικά στο ήδη γρήγορο gameplay του το C & C 4 Tiberium Twilight προσφέρει ένα ολοκληρωτικά νέο τρόπο παιξίματος.