Ο πρωτοποριακός σχεδιασμός του MasterBox 5 επιτρέπει την διαμόρφωση του κατά το δοκούν, μέσω των έξυπνων tray που μπορούν να μετακινηθούν ή να αφαιρεθούν εντελώς ώστε να υποστηρίξουν μεγαλύτερα, high-end περιφεριακά και συστήματα υδρόψυξης. Τα αποσπώμενα trays επιτρέπουν την εύκολη τοποθέτηση και διαχείρηση των αποθηκευτικών σας μέσων (HDD & SSD), παράλληλα με την μητρική, στο κάτω ράφι του κουτίου ή ακόμα και στο πίσω μέρος του tray (για τους SSD). Οι ευρύχωρες του διαστάσεις μπορούν να δεχθούν ψύκτρες ύψους μέχρι και 167mm, ενώ ακόμα και οι πιο ογκώδες και μεγαλύτερες VGA θα μπορέσουν να τοποθετηθούν χωρίς πρόβλημα μέσα στο κουτί σας (μήκος μέχρι 410mm). Το κουτί διαθέτει και κρυφούς χώρους για την διαχείρηση καλωδίων ώστε τα πάντα μέσα στο MasterBox 5 να είναι τοποθετημένα με τάξη.