Ο ήρωας του έργου, ο αστυνόμος Ακέλλας, είναι ένας αντισυμβατικός αστυνόμος, παροπλισμένος από το Ανθρωποκτονιών. Διοικεί το ΙΖ τμήμα Εξαρχείων, μαζί με τους πιστούς του «συνεργάτες», τον υπαστυνόμο Σήφη Μυριοκεφαλιτάκη, το δεξί του χέρι και άνθρωπο για όλες τις δουλειές, τη Μελίνα Αβιλάκη, την όμορφη αρχιφύλακα, απ’ τα «κελεύσματα» της οποίας με δυσκολία καταφέρνει να ξεγλιστράει, τον ευτραφή και μόνιμα πεινασμένο αστυφύλακα Μπάμπουρα, τον αστυφύλακα Κάβουρα που δεν του αντιστέκεται καμία κλειδαριά, αλλά και την Κλαούντια, την Αλβανίδα καθαρίστρια, που δεν αρκείται στα καθήκοντά της και μπλέκει συνέχεια στα πόδια του αστυνόμου εκνευρίζοντάς τον.

Στο τμήμα συμβαίνουν συχνά τραγελαφικές καταστάσεις, σε μία εύφλεκτη περιοχή, τα Εξάρχεια, την οποία όλοι οι νεοσύλλεκτοι προσπαθούν να αποφύγουν και αν έχουν την ατυχία να βρεθούν σε αυτή, κάνουν να αδύνατα δυνατά για να πάρουν μετάθεση.

Ο αστυνόμος Ακέλλας έχει τη δική του ηθική, τους δικούς του κανόνες για τη δικαιοσύνη. Είναι θυμωμένος με τους πολιτικούς και όπως χαρακτηριστικά λέει «έχουν ρημάξει αυτόν τον τόπο». Δε διστάζει να συνεργαστεί με τους αναρχικούς, με στόχο να εξοντώσουν τους εμπόρους ναρκωτικών. Και επειδή δεν μπορεί να απαλλαχτεί απ’ το μικρόβιο «της εξιχνίασης εγκλημάτων», αναλαμβάνει συχνά, και παρά τις αντίθετες εντολές της διοίκησης, δράση. Έτσι λοιπόν συμβαίνει και στο «Μυστικό του γάτου». Μια φαινομενική αυτοκτονία δε γίνεται πιστευτή από τον αστυνόμο Ορέστη Ακέλλα, με αποτέλεσμα να ξεκινήσει έρευνα «έξω απ’ τις αρμοδιότητές του». Το διήγημα ξετυλίγεται στα χρόνια της κρίσης, με την οικονομία να καταρρέει, την ανεργία να εκτινάσσεται και να δοκιμάζει την κοινωνική συνοχή. Με καθημερινές διαδηλώσεις από αγανακτισμένους και σκληρές συγκρούσεις με την αστυνομία. Σε αυτό το περιβάλλον ο αστυνόμος Ορέστης Ακέλλας ισορροπεί και καταφέρνει να διαφυλάξει την ακεραιότητα και την ασφάλεια των αντρών του τμήματος Εξαρχείων που βρίσκεται στο επίκεντρο των συγκρούσεων, αλλά επίσης αθόρυβα και μεθοδικά να καταφέρει να ανακαλύψει τι κρύβεται πίσω απ’ την «αυτοκτονία» του παιδιάτρου.

Εν τω μεταξύ, σε ένα εκρηκτικό περιβάλλον στο κέντρο της Αθήνας, όπου διαδραματίζεται η μεγαλύτερη διαδήλωση της χρονιάς, στη μνήμη του μικρού Αλέξη και τα δακρυγόνα να έχουν πλημμυρίσει την Αθήνα, ανακαλύπτει και το δεύτερο πτώμα, επίσης γιατρού, ενώ με την αναπάντεχη βοήθεια ενός γάτου βρίσκει την κρύπτη, όπου ήταν φυλακισμένο ένα μικρό κορίτσι.

Μετά απ’ αυτό, οι εξελίξεις είναι ραγδαίες, με τον αστυνόμο Ακέλλα να καταφέρνει αυτό που δεν μπορεί ούτε το Ανθρωποκτονιών, ούτε και το Τμήμα Ασφαλείας. Να ξετυλίξει τελικά το νήμα και να βρεθεί αντιμέτωπος με μία από τις μεγαλύτερες οργανώσεις εμπορίας παιδικών οργάνων στη νότια Ευρώπη.