Το ιπποτικό θρησκευτικό τάγμα του Αγίου Ιωάννη της Ιερουσαλήμ, για το οποίο κάνει λόγο ο Farochon στο βιβλίο του, ίδρυσαν Ιταλοί έμποροι από το Αμάλφι το 1048, για να υποδέχονται και να περιθάλπουν προσκυνητές του Πανάγιου Τάφου. Οι ιππότες του τάγματος του Αγίου Ιωάννη (Ιωαννίτες ιππότες) κατάφεραν με αιματηρούς αγώνες να εκδιώξουν τους μουσουλμάνους από τη Ρόδο και την κατέλαβαν το 1309. Το 1480 οι μουσουλμάνοι προσπάθησαν ανεπιτυχώς να ανακαταλάβουν το νησί.

Το 1522 πραγματοποίησαν νέα προσπάθεια, που είχε ως αποτέλεσμα να αποχωρήσουν οι ιππότες από τη Ρόδο την 1η Ιανουαρίου 1523 και να εγκατασταθούν στη Μάλτα. Οι Ιωαννίτες ιππότες σφράγισαν μια μακρά περίοδο ακτινοβολίας της Ρόδου. Κατά τους δύο περίπου αιώνες κυριαρχίας των ιπποτών, η Ρόδος γνώρισε ιδιαίτερη οικονομική ακμή, την οποία μάλιστα υποδηλώνουν τα μεγαλοπρεπή κτίρια της εποχής αυτής.